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巴斯德在上海揭示了Kaposi肉瘤中KSHV基因组的表观
浏览: 发布日期:2019-03-04
1月24日,国际重要学术期刊PLOS病原体是题为研究所“与卡波氏肉瘤卡波氏肉瘤的经典组织相关疱疹病毒基因组的后生景观的”上海巴斯德研究论文该公司宣布。中国科学院。
与卡波济氏肉瘤(KSHV)相关疱疹病毒属于家庭伽玛疱疹病毒的,和卡波济氏肉瘤(KS),原发性渗出性淋巴瘤(PEL),发生和恶性肿瘤如多中心疾病的密切两个KSHV从Castleman氏相关(MCD)的编码的90个或多个病毒基因,具有大的基因组(约170KB)示出它的生命周期中的潜伏感染并裂解复制的不同状态它是一种链DNA病毒。在潜伏感染的过程中,大部分病毒基因是沉默的,由此还没有被唯一病毒基因表达,以建立和保持一个潜伏感染状态的少数KSHV尚未完全阐明的机制。在以前的研究中,通过测量PE细胞病毒基因组的表观遗传状态,我们认为,表观遗传修饰是密切相关的病毒基因表达的调控。尽管KSHV基因组的后生地图是KSHV一个积极的,已经在体外培养已确定,在表观遗传状态KSHV潜伏状态尚不清楚这种病毒的KS临床病理生理条件已经报道了基因表达模式。由于缺乏KS能够稳定地代表病毒基因组的细胞系,在KS组织中的病毒基因组的外遗传状态直接确定。这非常重要。
在兰克博士的指导下,研究人员孙锐助理教授建立了染色质免疫沉淀法的高通量测序,可以直接SK(芯片起)的临床样本中使用的方法。KS KSHV样品(AcH3)和甲基化(的H3K27me3)在基因组中的组蛋白和潜在相关联的核抗原(LANA)基因组中的结合位点的比较,KSHV基因组的外观被建立经典KS样品中是的。结果,以类似于细胞系古典KS的H3K27me3转录物的抑制变形的结果广泛分布于基因组KSHV,改性转录激活AcH3表现出不同的模式,有限电位轨迹结果表明。也集中在LANA改性的H3K27me3最后一次迭代病毒基因组(TR)病毒干扰素的第三个因素调节在相同的组织和KS证实丰富的编码区,在基因组中的结合位点,警报器vIRF3在KS我检查了唱歌状态。转录复制子激活因子(RTA)是控制KSHV生命周期的重要分子。RTA启动子区,在细胞系中先前的结果是一致的已经富含的H3K27me3许多修改,有趣的是,TR以前在细胞系,大型浓缩AcH3区的报道没有观察到。成立于KS组织样本KS组织KSHV基因组的表观遗传观点提供了新的见解KSHV潜伏感染的机制,在一台主机,基于未来新疗法的研究和开发其重要提供基础。定向表观遗传学
这项研究,美国国家科学合作(地区)合作交流协会(NSFC-NIH),全国青年学者科学基金,已经由卫生项目的中国国家自然科学基金和国家研究院的支持,。健康(NIH)R 01。厄尔·罗伯逊,美国宾夕法尼亚大学的教授是这项研究的主要合作者,杨磊教授,医学杭州师范学院的谭教授小华已经提供了临床研究的支持。
KSHV基因组的表观遗传修饰的全景视图包含两个样品:第一个是2#,第二个是2#红色AcH3(顶部)的H3K27me3(下),和蓝色是入口。:VIRF区**:等待时间
vIRF的表观遗传修饰的和潜在的区域的放大图红色是AcH3(以上)的H3K27me3(下面),蓝色入口。